Для защиты планеты от предстоящего вторжения «Эволюционных захватчиков» были созданы особые воины, носители E-ген являющиеся реинкарнациями различных исторических личностей. Используя специальные сферы обладатели E-ген могут призвать любое необходимое им оружие и использовать его против захватчиков. Сио Огура — одна из таких носителей E-ген, реинкарнация Оды Нобунаги. Однако, ее воспоминания о прошлой жизни ограничиваются лишь снами о военном прошлом. Отправившись в школьную поездку в Тайвань Огура оказывается в центре сражения между Эволюционными захватчиками и владельцем E-ген. Воспользовавшись его сферой, Огура пробуждает в себе силы обладателя E-ген…

Будущий агроном и нынешний отаку Косаку Хата страдает: идол Юка Кусакабэ, которую он боготворил, навсегда покинула сцену. После этого известия друзья и одноклассники долго пытались выманить скорбящего Косаку из комнаты, а когда это у них наконец-то получилось, и парень отправился на занятия, выяснилось удивительное. Оказывается, та самая бывшая певичка под именем Ринго Киносита перевелась прямиком в класс главного героя.

Хикари Кохината — энергичная пятнадцатилетняя девочка, одержимая дайвингом. Жизнь в приморском городке привила ей безграничную страсть к подводному плаванию. Настолько безграничную, что даже вдали от моря Хикари не перестает «жить» им. На суше или на глубине — она всегда чувствует себя с аквалангом за плечами и не устает совершенствовать навыки погружения.
В первый день обучения в качестве старшеклассницы, на пути к школе, Хикари встречает своего будущего классного руководителя, Мато Катори, и невольно удивляется, когда узнает, что та — тоже дайвер. В этот же день она знакомится с Футабой Оки, новой одноклассницей, недавно переехавшей сюда из столицы. Дружелюбная Хикари быстро понимает, как подступиться к застенчивой длинноволосой красавице — и вот они уже подруги. Подруги, которые, как считает Хикари, затащившая Футабу в клуб дайвинга, должны разделять интересы. Даже если интересы поначалу не совпадают.

Сорей — человеческий юноша, выросший среди серафимов (это такие волшебные создания, которых обычные люди видеть не могут). Сорей верит в предание, согласно которому «давным-давно любой человек мог видеть серафимов», мечтает раскрыть древнюю тайну и сделать так, чтобы серафимы с людьми могли жить в мире. Однажды Сорей впервые попадает в столицу людей и случайно оказывается связан с цепочкой неких событий, в результате которой вытаскивает из камня священный меч. Таким нехитрым образом он становится Пастырем, который оберегает мир от бед.

Главный герой, Чо Соран, по традиции вел жизнь обычного студента, пока в один ужасный день не угодил в переплет на краю какой-то деревушки. Непринужденно прогуливаясь по ночному кладбищу, парнишка неожиданно был атакован зомби. И вот, когда казалось, что Чо вот-вот распрощается с жизнью, откуда не возьмись появилась таинственная красотка и мигом пустила трупоеда на кебаб. Само собой, сея встреча мигом изменила жизнь унылого героя, открыв врата в мир сверхъестественного.

Со времен «дела Скальетти» минуло четыре года. Мид-Тилда залечила раны, Шестой отряд распустили, но его бойцы продолжают службу в Бюро Пространства и Времени, многие – с карьерным ростом. Лишь капитан Наноха Такамати вышла в отставку, чтобы воспитывать приемную дочь, ибо малышка Вивио – одна из сильнейших волшебниц поколения, за такой пригляд нужен. И Наноха, и ее лучшая подруга Фейт стараются, чтобы у девочки было нормальное детство, ведь обе на собственном опыте знают, что ускорение развития мага не приводит ни к чему хорошему.

В честь поступления в 4 класс магической академии Вивио получила разумное устройство по имени Святое Сердце, и теперь снова может принимать взрослую форму, в которой сила и возможности резко возрастают. Очень вовремя: ведь в районе завелся бандит, что подкарауливает одиноких прохожих и вызывает их на поединок, словно в старые добрые времена! Если на Земле добропорядочные девушки все бы прятались по домам, то в мире Нанохи они только рады возможности познакомиться и подружиться с интересными людьми. Если что – галактическая медицина поможет: не верите – спросите участниц предстоящего турнира боевых искусств!

В апреле 2009 года н. э. таинственная гигантская форма жизни, названая Имаго, начала захват Земли. Уже 45 лет идёт война, но атаки Имаго невозможно остановить, поэтому человечество приготовилось к последнему, решающему удару…