События Дельты разворачиваются в 2067 году, спустя 8 лет после событий показанных в Macross Frontier.

Когда Коноэ Мояко и её младший брат Акира были детьми, Акира сказал, что хочет жениться на Мояко. Из-за этого она решила, что ее младший брат конченный извращенец с комплексом сестрёнки. Теперь, когда они уже подростки, Мояко окончательно уверилась, что это действительно так, и во что бы то ни стало его нужно «реабилитировать». Однако, судя по всему, все его «извращения» находятся лишь в её воображении...