Ни в одной из пяти стран никогда не было персонажей, которые бы хотели обзавестись абсолютной властью за счет других. Синоби с Кровным даром начинают загадочно исчезать из деревень: Камня, Травы, Песка и Облака. Исключением остается только деревня Листвы, что вызывает серьезное подозрение у остальных наций. Разведка Конохи, вмиг, вычисляет следы пропавших. Они ведут к горе Сумисэн. Неудачная попытка добыть информацию, повлекла неожиданные последствия – над деревней Листвы появилась огромная фигура, которая известила о начале Великой войны. Коноха попадает в беду. Князь Огня приказывает Цунаэ, как можно быстрей отыскать виновного или готовится к уничтожению. В это время соседи стягивают войска и совсем не слушают доводы разума. Хатакэ Какаси собирает все сведения воедино и решает пожертвовать собой ради существования деревень. С камнем на душе, стратеги Листвы и Песка соглашаются с таким выбором. Ведь побеждают лишь те, кто голосует сердцем.

Наруто Узумаки, обвиненный в убийстве нескольких Джонинов из Кири и Ивагакуре, а так же в покушении на Райкаге, попадает в Хозукиджо – «Кровавая тюрьма». За короткое время пребывание в тюрьме, Наруто начинает догадываться, что Муи – хозяин тюрьмы, высасывает чакру из своих заключенных. Он узнает, что его посадили в тюрьму именно для того, что б из него высасывали чакру и планирует побег. Далее всплывают события того, что Муи подставил Наруто. Он хотел открыть ящик, который исполняет любые желания. Для этого ему необходима чакра Наруто. Так он хочет воскресить Муку, своего умершего сына.